Геноміка мікроорганізмів

Експлоджен здійснює сукупність послуг з геноміки: від секвенування до біоінформатичного аналізу

Секвенування
та біоінформатика

Маючи доступ до кількох поколінь технологій секвенування, від Сенджера до третього покоління, компанія Експлоджен пропонує послуги із секвенування окремих фрагментів ДНК та цілих геномів мікроорганізмів. Наші експерти в галузі секвенування та біоінформатики виберуть найкращий варіант послуг для ваших потреб за оптимальною вартістю. Ми маємо досвід у de novo складанні та анотації геномів бактерій, грибів та найпростіших.

Ми також пропонуємо секвенування та аналіз ампліконів (в тому числі метагеномних): 16S, ITS, послідовності дарпінів та імуноглобулінів. Це, також, охоплює ідентифікацію різноманітних мікробних забруднень.

Нашою метою є надання комплексних послуг із геноміки та біоінформатики:

  • контроль якості секвенування;
  • збірка та анотація;
  • редагування анотації;
  • пошук та аналіз нуклеотидних замін (SNPs);
  • зміни числа копій (CNV);
  • пошук структурних варіацій (SV’s);
  • передбачення функції генів;
  • філогенетичний аналіз, та ін.

Поточні проекти:
Геноми: 4 бактерійні геноми секвеновано; 10 в процесі. Заплановано 100 бактерійних геномів до кінця 2020.
Фрагменти ДНК: здійснено більше 600 секвенувань за Сенджером.
Праймери: більше 100 синтезовано.